Hipoteca Local Autonomo.

Buenas tardes, tengo una duda y no encuentro respuesta.
Hace poco mi mujer y yo compramos un bajo comercial, como es logico pagandolo con una hipoteca.
Ese bajo lo utilizamos como negocio para el negocio de mi mujer la cual es autonoma, anteriormente ese local lo teniamos en alquiler, con lo que podíamos desgravarnos el importe correspondiente en los trimestrales.
Quisieramos saber si el importe de la hipoteca, nos lo podemos desgravar como autonomos en que cantidad de % y como hacerlo.
Muchas gracias y un saludo.