Admistrador SLU Factura o Nomina

Hola, 

Tengo algunas dudas :

1) La sociedad me paga la cuenta de autónomo societario
2) Me paga la nomina no le facturo yo a la sociedad.

Esto es correcto y recomendable ? 
Me puede causar algún problema con hacienda ? 
Hay una manera mejor para optimizar la fiscalidad ?

Gracias