El principio general en la materia se recoge en el artículo 7.4 del Real Decreto 84/1996, de 26 de enero, por el que se aprueba el Reglamento General sobre inscripción de empresas y afiliación, altas, bajas y variaciones de datos de trabajadores en la Seguridad Social
4. Cuando una persona ejerciere simultáneamente distintas actividades o la misma actividad pero en condiciones o en formas diversas que dieren lugar a su inclusión en diferentes Regímenes del sistema de la Seguridad Social o en el mismo Régimen por cuenta de más de una persona, su encuadramiento será múltiple, constituyendo las situaciones de pluriactividad y de pluriempleo respectivamente.
1.º A efectos de lo previsto en este Reglamento, se considerará pluriactividad la situación del trabajador por cuenta propia y/o ajena cuyas actividades den lugar a su alta obligatoria en dos o más Regímenes distintos del sistema de la Seguridad Social.
2.º A los mismos efectos, se entenderá por pluriempleo la situación del trabajador por cuenta ajena que preste sus servicios profesionales a dos o más empresas distintas y en actividades que den lugar a su alta en un mismo Régimen de la Seguridad Social.
5. Únicamente podrá optarse entre diversos Regímenes del sistema de la Seguridad Social, para su alta en uno de ellos, en los casos en que se reconozca expresamente tal opción, con el alcance y en las condiciones fijadas en la norma que la establezca.
Tú te encontrarías en situación de pluriactividad, realizando dos actividades que dan lugar, en principio, al alta obligatoria en dos diferentes Regímenes de la Seguridad Social, por un lado el Régimen Especial de Trabajadores del Mar –por cuenta propia o autónomos-, en el que ya estás dado de alta, y por otro el Régimen Especial de Trabajadores Autónomos, en el que deberías darte de alta al iniciar la actividad de programador web por cuenta propia. Donde te hayan informado de que no puede ser así, que te especifiquen la norma, y su artículo concreto, que establece la excepción al principio general de dos altas en dos Regímenes distintos y permanencia simultánea en ambos sea cual sea el nivel de ingresos.