Dudo que sea por el sobrante ya que solo es un 0,15%. De todas formas si multiplicas lo que te han dado por 1,0015 obtienes la cantidad que te habrían dado sin descontar la comisión. (1000 * 1,0015 = 1001,5€ sería la cantidad antes de comisión).
¿Cómo calculas la cantidad?
Yo la fórmula que uso es CantidadInvertidos - (CantidadInvertidos / (1 + (PorcentajeLetras / 100) * DíasInversión / 360 )).
Por ejemplo para una inversión de 10.000€ al 3.60% durante 180 días sería así: 10000 - (10000 / (1 + (3,60 / 100) * 180 / 360 )) = 176,82€ de sobrante antes de comisión.
Yo no le veo mucho sentido tampoco. Se supone que hoy entra en vigor las nuevas letras que se adjudicaron, por lo que no tendría sentido que tengas circulando las nuevas y las viejas a la vez el mismo día...