un exemplo,un fp son 1000h anuales distribuido por exemplo por 5 asignaturas,por iso tendrias que aprobar a 500h como ninimo.en tu caso debe ser que esas 3 que aprobaste en su totalidad no llegaran a las 500h anuales.tienes que mirar cuantas horas valen las 3 que aprobaste.
no tiene que ver que aprobaste 3 asignaturas y solo suspendeste 2.tiene que ver las horas .cada asignatura tiene sus horas totales y son esas horas que cuentan.
yo creo que se algo está mal el ministerio te llama o avisa por carta de los errores.yo cobri las becas de fp medio y solo me tuvo que registrar el primero ano,el segundo ano entras con los mismos datos.iso es solo un registro y despuies mas tarde creo que agosto o set.hay que cobrir la definitiva