Yo creo que cuando llegues al banco te van a hacer la ola. Esas dos cargas son muy pequeñas teniendo en cuenta tu sueldo y además siendo funcionario.
De todos modos puedes visitar o llamar a cualquier oficina, les explicas lo que acabas de exponer aquí y en breve te contestan si te concederían la hipoteca o no (que ya te digo yo que sí).
Normalmente las arras suelen tener alguna cláusula de excepción en la que se permite la devolución de las arras, una de esas excepciones suele ser el no conseguir la financiación por parte de la entidad bancaria como sería tu caso.