¿Puedo montar este negocio....?

Si vas a un concurso (no tú, el farmacéutico), no tiene que pagar esa licencia, sino la que marque el Ayuntamiento por licencia de apertura de negocio, más lo que haya que pagar a la Comunidad autónoma por el concurso, que dependerá de lo que establezca cada Comunidad para cada concurso.
Otra cosa es que quieras comprar una farmacia ya existente (no tú, tu socio farmacéutico): tendrás que pagar el precio que acordéis, que normalmente se fija en función de la facturación de tres años. Así que el precio puede ser muy bajo para una farmacia que no rinda y muy elevado para farmacias con muchos beneficios (lo que tiene el riesgo de que el Tribunal europeo declare que el sistema español no se ajuste a la normativa europea de libre competencia y hayas pagado en función de unas reglas que no se seguirán aplicando en el futuro).
Vaya, que no le des más vueltas, que mires otro negocio.