Exacto, míralo bien porque son bastantes cosas.
Motor de dos tiempos o cuatro tiempos significa hacer mantenimientos diferentes.
Impuestos y demás no sé cómo van (yo tengo ciclomotor, pero no 125cc, y porque era heredado), por eso te comento que es importante que lo mires.
Ahora, en cuanto a versatilidad, yo casi te diría que una 100 o 125cc. que puedas circular con ella por carretera en un momento dado te sacará de un apuro mejor que un ciclomotor, ya que puedes llevarlo también con el carné B, en principio.
Pero en última instancia, también has de ver la diferencia de costes en cada caso y hacerte un cuadro para ver si te compensa en caso de hacerte una estimación de amortización.
Saludos,