Hola,
Por lo que comentas, entiendo que lo que tienes es una cuenta remunerada. Siendo así, tu puedes quitar ese dinero cuando convengas, e incluso hacer transferencia a tu otra cuenta "normal" y operar de forma habitual. Si es así, ninguna comisión ni penalización por nada; simplemente los intereses que te esté generando ya no te los daría.
En un depósito ese dinero queda "bloqueado" por un tiempo limitado, es como si tu hicieras un prestamo al banco, y entonces si lo quieres cancelar antes sí te pueden penalizar.
Si es dinero que no vas a utilizar sin duda abre un depósito mejor, la rentabilidad es mayor logicamente. En NCG estan dando 4.20 nominal a un año, pero creo que exclusivamente en oficinas.
Si lo que quieres es "agilidad" online te recomiendo tubancaja, tiene depositos a 4% y sin comisiones de ningun tipo por la cuenta ni por transferencias (para quitar dinero de NCG sin comision puedes lanzar una OTE). Además si cancelas los depósitos te dan el 3% del tiempo que hayas estado, que es una penalización "justa". Otra opción es ING, similar a tubancaja.