En mi caso Mi4X. Como decís, así siempre lo he hecho yo, pero ignoro el por qué, desde hace poco no me sale la opción de transferir archivos o de solo cargar el dispositivo, por lo que solamente carga el teléfono.
En consecuencia, ni AFT ni APOWERMIRROR reconocen la existencia del teléfono.
Debe ser alguna actualización dichosa que te trastoca otras cosas.
En opciones de desarrollador, está activada "Depuración USB", también "Instalar vía USB" y en Seleccionar ajustes USB, marco MTP, aunque pese a ello, al volver a la anterior pantalla siempre se ve "Cargando". No sé si hay algo más que impide que esté activado MTP y por tanto no se ofrece la opción, solamente carga y ya está.