Eso podría ser por lo siguiente, si tienes varias cuentas de Google en tu teléfono y por ejemplo las compartes con alguien puede llegar a pasar, e explico. Imagina que tienes la cuenta de Gmail de un hermano, por temas de sincronización si el guarda sus contactos en su cuenta de Gmail es bastante probable que a ti no te aparezcan en la agenda pero si en WhatsApp con el nombre que esa persona le haya puesto. Aun así te dejo un enlace a unos cuantos consejos acerca de WhatsApp que es bastante útil , espero ser de ayuda :) Salu2