Buenas tardes:
Me pasó exactamente lo mismo hace dos años. Primero tuve que reclamar al instituto para que justificara las faltas injustificadas, de las cuales las mayorías estaban justificadas con certificados médicos pero al tutor se le había pasado hacerlo. Una vez que comprobaron que las faltas estaban debidamente justificadas, cambiaron el estado de las mismas en el CAUCE. Para hacer esto tendrás que esperar al 1 de septiembre, puesto que si no me equivoco los institutos están cerrados durante el mes de agosto. Por otro lado, tendrás que interponer un recurso de reposición alegando que ha habido un error por parte del instituto que no han justificado correctamente las faltas. Espero que te sirva de ayuda.