El IVA, como bien dices al inicio se paga por la diferencia entre el soportado y el repercutido, PERO, DEBES TENER EN CUENTA, que el repercutido es sobre lo que factures NO sobre lo que gastes y los salarios , seguros, etc. son gastos no facturas que generan IVA.
Osea que a rehacer los numeros que ahora igual te cuadra. Saludos.
España