Me va a ser difícil contestar uno por uno todos los estudios. Aunque pueda no parecerlo, soy un currante con no mucho tiempo libre.
A ver, sobre el estudio de la PCR en Gonococia (2007). Solo me he podido leer el abstract (ni estoy suscrito a Ned Tijdschr Geneeskd, ni se alemán). Se utilizaba un fragmento genético que era igual a otras Neisseria. Desconozco el kit utilizado, porque tanto para el estudio del gonococo como del meningococo (otra neisseria) el gold standard es el cultivo. Que además, es muy rápido, pues el bicho crece en 48 horas, con antibiograma incluido. No se utiliza PCR para estos bichos. Los cultivos virales, en cambio, son difíciles de realizar, pueden tardar hasta 3 semanas en dar resultados, son caros y con una baja tasa de éxitos. El fragmento de PCR utilizado en el ébola y en el HIV es específico de este, no tiene nada que ver con la PCR a Neisseria, que repito, no se suele utilizar en la práctica clínica habitual. Sí, que se utiliza la de enterovirus o herpes virus, por ejemplo.
Sobre el genoma del HIV: sí que está aislado. Si no completamente, sí por lo que respecta a sus genes productores de proteínas: son los genes pol, env y gan, entre otros. Estos genes NO son específicos del HIV, solo de los retrovirus. Además, de este, otros genes, como el Tat o el Rev. De hecho, varios antiretrovirales actúan con eficacia a este nivel.Para el diagnóstico por PCR se utilian genes específicos de HIV. Actualmente, incluso, de HIV1 o HIV2.
Que si se descartan las otras enfermedades? Si, se descartan. Además, la comorbilidad de estos pacientes (los africanos) es habitual, por lo que no solo es una obligación en cuanto al diagnóstico del ébola, si no en cuanto al resto de enfemedades que puede tener el paciente. Es decir, puede tener el ébola añadido a un paludismo. Que se descarten, no quiere decir que deban realizarse pruebas diagnósticas en todos los casos. Es decir, si el paciente no tiene signos meningeos no hace falta pincharle la espalda y si no ha tenido fiebre recurrentes porque es un paciente español como M.Teresa, seguro que no le han buscado ni el Paludismo ni la Fiebre Recurrente (porque aquí no hay paludismo), aunque si es un africano que viene de Sierra Leona, pues con una simple gota gruesa y una buena tinción se diagnostica o descarta en 5 minutos (tanto una, como otra). Tampoco creo que hayan aislado al V.colera ni la shigela, esta última, relativamente frecuente en nuestro medio.
Respecto a los estudios sobre carga viral y PCR. Los kits actuales de PCR, no solo tienen una sensibilidad y especificicidad cercana al 100% si no que te permiten calcular la carga viral de forma extraordinariamente precisa. No valen los estudios del 2000 o 2007.
Carga viral alta, quiere decir, que bajen los linfocitos CD4, de importancia vital el la inmunidad. Por debajo de 500, empiezas a tener enfermedades infecciosas que en el huesped sano con inmunidad conservada no se tienen. Y por debajo de 200, las enfermedades son constantes y los antimicrobianos y antiparasitarios ya no pueden actuar.
Antes de la época de los antiretrovirales, la secuencia era.
Sospecha HIV -> Detección (no por PCR) por 2 métidos distintos --> Empiezan a bajar los CD4 (las defensas) --> Primera infecciones más banales y no mortales (candidiasis, retinopatía por CMV) --> Bajan las defensas CD4+ por debajo de 200 --> Cascada de infecciones como neumonia por P.carinii, histoplasmosis, toxoplasmosis cerebral, TBC diseminada.
En aquel momento, incluso alguna enfermedades formaban parte del DX de HIV. http://www.ctv.es/USERS/fpardo/vihclas.htm
Actualmente, el diagnóstico es muy precoz, pues la PCR permite la amplificación genética. Ello quiere decir que pequeñas cargas virales ya pueden ser detectadas. Además los antiretrovirales son eficaces y mucho menos tóxicos que al principio. Ello permite:
a). Que el Dx de realice precozmente gracias a la PCR.
b). Que se pueda iniciar precozmente el tto.
c). Que los CD4 se mantengan por encima de 500 y las cargas virales se minimicen.
d). Que ya no veamos aquellas enfermedades que veíamos cuando no teníamos los antiretrovirales o se tenían que suspender debido a la alta toxicidad o a la resistencia que había adquirido el enfermo.
Si, Sr. Llinares, el SIDA existe, y el ébola, también.