La diferencia entre comprar monedas y el SLV es el Spread (diferencia entre el precio al que compras y al que venderás), ya que en las monedas es más elevado, aunque en el SLV te cobran esa comisión que hay que tener en cuenta.
Por ejemplo si quieres comprar el ETF SLV lo puedes comprar con un diferencial de un céntimo... iShares Silver Trust (SLV) (habría que tener en cuenta la comisión) Ahora lo comprarías a 21,28 $
Mientras que si compras monedas, las comprarías a 21,38 en este momento y el diferencial es mayor, aunque no veo exáctamente cuál sería el precio al que puedas vender y desconozco si además de ese diferencial también hay que pagar alguna comisión más.
Un saludo!