Economicamente creo que va a depender y mucho del volumen de facturacion, de deuda que esteis moviendo o necesidades de crédito. Como tu mismo indicas economicamente lo mismo no te interesa una SL. Juridicamente pudiera ser por el tema de la responsabilidad. En responsabilidad la Sociedad Civil se responde ilimitadamente, asi que si manejais deudas altas o estais en un mercado con posibles demandas...pues, no parecería la mejor opción juridica.
Y bueno, si lo comparas con una SL si que la Sociedad Civil reducen los tramites formales, pero casi sólo de constitucion, que ya no es como antes. Desde 1 Enero de 2016, las SC tambien se rigen ya por el Impuesto de Sociedades, asi que.. contabilidad ajustada, presentacion de cuentas anuales, etc, etc...algunas Asociaciones se quejaron ya que la SC suelen ser pequeñas y familiares y les están obligando casi a lo mismo que a las SL. En resumen, ha cambiado la tributacion de las SC y ha aumentado las cargas fiscales y contables....incluso se prevé desaparición y conversion de muchas SC en SL o directamente volveran a autonomos. Hasta Hacienda habilitó en su mmento un regimen especial de disolución, con beneficios fiscales, para las SC que ya no quisieran seguir siendolo.
Desde mi punto de vista solo con numeros y objetivos empresariales concretos podrás tener una decisión clara. Cada contribuyente es un mundo, pero quizá para hacerte una idea básica...se dice habitualmente que una SL no interesa fiscalmente si no están por encima de los 100 o 150.000 € año en facturacion.
Haceis bien en pensarlo porque, al parecer, los modulos tienen los dias contados.
Saludos