Cuando abras el RentaWeb te saltará, casi al principio, antes de dejarte ver el resultado que arroja tu borrador, una ventana emergente en la que te preguntará si ese préstamo hipotecario es deducible (no lo es); basta con que digas que no, y ya te deja continuar, sin que aparezca nada al respecto en tu declaración.
Comprueba, de todas formas, si, en tu Comunidad Autónoma, hay alguna deducción autonómica por esa compra (como en Euskadi, creo); si es así, y cumples los requisitos que se exijan, deberás modificar el borrador para solicitarla (no aparece por defecto).