La primera pregunta amortizar o destinar el dinero a otra inversión depende principalmente de la rentabilidades y riesgos esperados, si pagas poco interés pues quizás no quieras amortizar y destinarlo a otra cosa, incluso puede darse el caso de tener un tipo de interés fijo de la hipoteca y que el banco por tu depósito te dé más de ese % con lo cual sería ridículo amortizar, a tipo variable no sucederá esto y además debería tenerse en cuenta el riesgo de que suban los tipos sobretodo si se invierte en un activo iliquido que después cueste liquidar esa inversión si vienen mal dadas.
El segundo a menos que haya una importante comisión por amortización anticipada siempre interesa reducir cuota, el motivo es que el dinero que recibes o que te ahorras cuanto antes lo recibas mejor, esos mismos euros tienen un poder adquisitivo mayor ahora que de aquí 10 años y menos riesgo, con una cuota más baja podrás ahorrar más rápido dinero y te pagarán intereses por ese dinero o podrías invertirlo, además siempre podrás amortizar más si quieres cada mes y tendrás menos riesgos de no poder pagar la cuota si vienen mal dadas.
Ahora eso sí, si tienes comisión por amortización anticipada alta el bajar cuota significa que pagarás menos de cuota (sin comisión) y por tanto si eres de ir haciendo amortizaciones parciales pagarás más amortizando (con comisión).
Perdoneme el atrevimiento quizás pero creo que podría serle interesante leer sobre el modelo de DFC o Descuento de flujo de caja en el que trata precisamente eso, la importancia de los retornos pero también del momento en que se reciben.
Un saludo.