Factura REBU - Gastos Gestoría

Buenas tardes. 
Tengo una empresa de compra venta dada de slta para operaciones intracomunitarias . Una de las compras a una empresa francesa de un bien de 2a mano me han emitido una factura aplicando el IVA y ahora Hacienda me reclama ese impuesto. Me dicen que si me modifican la factura de la empresa francesa se soluciona, pero esta empresa no lo hace. Tienen obligación?. Puedo o que debo hacer. Gracias de antemano 

Alguien puede ayudarme?