Buenas noches María!
Al menos en Asturias, solicitan las facturas al finalizar el curso escolar.
Hubo un año que no me pudieron localizar (en plazo) y me enviaron un requerimiento de todo el importe de la terapia junto con la documentación de hacienda para que hiciese la devolución íntegra, ya que, según ellos, al no presentar las facturas, se entendía que el dinero no había sido destinado para su finalidad. (Al final pude demostrar que no había sido error mío) y las pude presentar aun fuera de plazo.
Te explico todo esto porque al menos aquí, parece ser que las liquidaciones se hacen en el mismo año.