En mi opinion, deberias hablar con tu compañia de seguros debido a que piden el juego de dos llaves del coche ya que una de las excepciones para indemnizar por robo del vehiculo es que si has dejado las llaves puestas o con cualquier sistema activo en el interior que permita abrir el vehiculo se considera hurto en vez de robo. Debido a esto al no tener las dos llaves tu aseguradora puede negarse a indemnizarte basandose en que es un hurto.
Otra posibilidad que tienes es esperar a que aparezca el vehiculo en cuyo caso recuperaras tu vehiculo y te pagara los posibles desperfectos que pueda tener, o si aparece el vehiculo pero con piezas robadas, se te indemnizará por esos daños.