Los sistemas informáticos de los bancos y cajas suelen estar montados con memoria histórica, con lo cual si dejas una cuenta a cero, o a 27 céntimos a la primera liquidación se los comen, luego y en teoría (seguridad ninguna) de vez en cuando hace un “barrido” de cuentas a cero y las cancelan, sin embargo no se te ocurra volver a utilizar la cuenta caso de que no la cancelen de forma automática, la memoria histórica se activará y te “clavaran” todo lo debido, si quieres volver a trabajar con dicho banco o caja, abre una nueva cuenta, no “reutilices” la antigua.
Las recomendaciones de “buenas prácticas” del BdE no permiten cargar comisiones (a excepción de las procedentes de descubierto por poner un ejemplo) y provocar un descubierto, pero no creo (bueno estoy casi, casi seguro) que si abres una cuenta nueva no te pueden aplicar lo debido por comisiones de otra cuenta.