Si realizáis la declaración conjunta, es practicamente imposible que tengáis problemas.
Lo que puede ocurrir en estas situaciones en el caso de que hicierais declaraciones individuales, es que lo declarado por cada uno de los cónyuges no coincida con los datos que tiene la Agencia Tributaria y que facilitan los bancos.
Como ejemplo y basándome en tu comentario, explicas que vas a tener unos intereses de ING que el banco informará que son únicamente tuyos, cuando en realidad te corresponden la mitad. La otra mitad, son de tu mujer.
Esto puede ocasionar que puedas recibir un requerimiento de hacienda para que aclares la situación o que, si la declaración te sale a devolver, pueda sufrir un retraso.
Por tanto y para tratar de minimizar todos los riesgos lo más conveniente creo yo, es que en todo tipo de cuentas se deben incluir como titulares los dos cónyuges porque ambos son los dueños del dinero.
Saludos.