Hola,
yo había leído que presentar una rectificación te lo retrasaba, pero creo que eso no es así. El 5 de Abril presentamos la de mi pareja y la mía. En las dos al día siguiente, 6, presentamos una rectificación de la autoliquidación para modificar un dato erróneo que no afectaba al resultado de la declaración. Ella tiene hoy, día 17, el dinero en su cuenta. La mía ni se ha movido, pero yo puse una deducción extra que ella no tiene y supero los 1000€ de devolución y ella está un poco por debajo de esa cifra. También he visto que a veces te tramitan la primera versión y más adelante revisan la rectificación. Así que en principio has hecho el paso correcto, presentar una rectificación y en teoría no debería afectar a los plazos.