Bueno,
Cuento mi experiencia por si le sirve a alguien, aunque ha sido parecida a la de otros usuarios de este foro.
Declaración conjunta presentada 7 de abril. No aparecían datos duplicados en el borrador, tampoco se veían datos duplicados si entraba en Rentaweb. Sin embargo sí que aparecían duplicados los rendimientos de trabajo así como los inmuebles en el PDF que se generaba tras la presentación.
El 2 de junio, harto de esperar y de ver el mensajito de "su declaración se está tramitando", decidí solicitar anulación.
El 8 de junio quedó anulada y dejó de aparecerme en la app móvil. Revisé borrador y volví a presentarla: ya no aparecían datos duplicados en el PDF.
Hoy 10 de junio aparece como tramitada y se me informa que se estima conforme la devolución, por lo que espero que en pocos días la recibiré en mi cuenta.
Por tanto parece que cuando hay duplicados compensa pedir la anulación tal y como ya dijeron varios compañeros del foro.
Saludos y suerte.