Con los datos que facilitas veo lo siguiente:
1) En el fondo se invirtieron 15 millones de pesetas, esto es 90.151,82 euros.
2) Cuando se rescató en 2007 se entregaron 106.000 euros, con lo que hubo un rendimiento positivo. Este rendimiento positivo estaba sujeto a una retención a cuenta del 18%.
Hagamos cuentas: 106.000 euros - 90.000 = 16.000 euros netos.
A estos 16.000 euros netos le tendríamos que añadir la retención que se le descontó del 18% y nos darían unos 19.500 brutos (más o menos en números redondos).
3) En conclusión, el fondo tuvo un rendimiento bruto de unos 19.500 euros.
Por lo que indicas, o me parece entender, el fondo paso de tu hermano difunto a tus padres, por lo que es a ellos, a tus padres, a quien se les tiene que atribuir el rendimiento bruto del fondos, que, grosso modo, coincide con lo que Hacienda dice: 10.000 euros por persona, 20.000 en total.
Si en su momento no se hicieron constar estos rendimientos en la declaración de tus padres es normal que la AEAT lo reclame.
Un saludo