Opino igual que Eduardr6, PayPal tendrá que ponerse las pilas con el tema de las comisiones o bien reinventarse, en parte ya lo ha hecho. No hace falta ser el dueño de un negocio, basta con que uno venda algo a través de eBay para conocer bien las comisiones, una sablada.
Por otra parte, el pago con tarjeta está a la orden del día, antes la gente desconfiaba más, pero ya de un tiempo a esta parte pagar de esta forma es el pan nuestro de cada día.
De todas maneras, y si vamos a tu pregunta, yo de momento no he tenido esa percepción de que no permitan pagar con saldo PayPal, pero bueno, la verdad es que como no compro mucho online tal vez no me haya dado ni cuenta. Saludos!