Es como tú dices. El alias es el mismo que pongas en Beneficiario. Ahora entiendo tu problema.
Como la mayoría de mis favoritas son cuentas propias, con poner banco de destino como beneficiario (Pepe Openbank) no me importa.
Si lo que tienes son diferentes cuentas de las mismas personas o entidades yo te sugiero que pongas Nombre Apellido1 Apellido2 en una y Nombre Apellido1 en otra por ejemplo, o bien Nombre Apellido1 Apellido2 en una y Apellido1 Apellido2 Nombre en otra; o bien otro sistema como Nombre_Apellido, Nombre_Apellido_ (observa los guiones, pueden ser comas, guión "medio", etc) o cualquier otra que se te ocurra. En caso de empresas, a uno añades SA o SL detrás y al otro no.
Yo odio que no me admitan poner acentos ya que si los pongo desaparece la vocal. Otra forma de diferenciar un mismo destinatario: Mart nez, Martinez sin que se ofenda porque es, desgraciadamente, muy habitual.
Finalmente, te puedes "olvidar" alguna letra en el apellido o nombre del receptor en uno de los dos alias.
No sé qué más decirte. Espero que al menos te dé alguna idea, aunque sean algo chapuceras, para solventar tus necesidades.