Valor real del inmueble heredado - opciones

En el Impuesto de Sucesiones se puso el valor catastral del inmueble, ahora al hacer la declaracion del IRPF resulta una ganancia patrimonial muy alta. Puedo poner el valor real del inmueble que ha tasado hacienda, en lugar de poner el valor que se puso en la declaración del Impuesto de sociedades?

En este enlace se explica qué valores debes añadir en caso de que sea heredado el inmueble.

En principio no, debes poner el valor declarado en sucesiones. Otra cosa es que si pones el otro (supongo que te refieres al de referencia calculado según las normas de la CA), tengas argumentos para defenderlo cuando te requieran. Quien sabe si al final podrías conseguirlo

¿Que valor se reflejó en la escritura de aceptación de herencia?
Porque eso es lo que en el caso hacienda te requerirá, la escritura. Ni el impuesto de sucesiones, ni el papelito con la estimación de valor de la hacienda autonómica, sino el "título" mediante el que adquieres esa propiedad, y el valor reflejada en ese título.