Hola! Yo tengo el contrato también con mi pareja, los hemos sido beneficiarios de la ayuda y los dos estamos en el contrato del piso, en mi caso mi pareja paga el alquiler a su nombre, pero yo siempre le he pasado un bizum con mi parte que me corresponde, por lo tanto el ha subido los recibos con el pago total del alquiler de cada mes y yo he subido los recibos mensuales mas mis justificantes de bizum que le hago a mi pareja todos los meses, donde se comprueba que yo pago mi parte dle alquiler.
No se te he podido ayudar, en tu caso entiendo que si alguna vez lo paga el y tu otra, tendras que justificar que a el tu le pagas la parte que te corresponde los meses que los paga el.
O si los dos estais en la misma cuenta, entiendo que si justificais que sois ambos titulares de la cuenta os valdría entiendo.