Hola Pablo.
Si sois cotitulares de la cuenta, la SS podría considerar que sois propietarios de ese dinero al 50% y dependiendo de la cuantía de los ingresos y del saldo pueden ponerte pegas. Pero si podéis demostrar que esos ingresos son 100% de ella (con nóminas si es asalariada o facturas si es autónoma) y no vivís juntos, no debería haber mayor problema de cara al IMV. Hacienda sí que te atribuirá la mitad de los rendimientos de la cuenta (de haberlos) en el borrador de la declaración, pero ese es otro tema.
Lo más sencillo para no tener que preocuparte por el IMV ni Hacienda es que la titular sea ella y tú sólo seas autorizado en la cuenta. De este modo puedes operar libremente pero queda establecido que el dinero no es tuyo y ni Hacienda ni la SS se preocuparán por ello.
Un saludo.